More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0184 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  100 
 
 
476 aa  962    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  70.6 
 
 
465 aa  631  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  63.76 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  63.97 
 
 
462 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  53.68 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  53.68 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  53.03 
 
 
458 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  53.25 
 
 
458 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  53.03 
 
 
458 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  53.25 
 
 
458 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  54.65 
 
 
449 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  53.25 
 
 
458 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  52.81 
 
 
458 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  52.81 
 
 
458 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  52.81 
 
 
458 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  52.81 
 
 
458 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  55.75 
 
 
460 aa  482  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  52.41 
 
 
484 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  54.91 
 
 
457 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 
457 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  51.53 
 
 
453 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 
457 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  51.19 
 
 
457 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  50.87 
 
 
454 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  52.75 
 
 
462 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  52.09 
 
 
462 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  51.54 
 
 
454 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  51.32 
 
 
454 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  51.32 
 
 
454 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  50.56 
 
 
450 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  48.07 
 
 
507 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  52.19 
 
 
453 aa  458  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  52.59 
 
 
448 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  54.46 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  51.78 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  53.38 
 
 
450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  47.28 
 
 
520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  51.43 
 
 
453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  47.46 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 
453 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.33 
 
 
453 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 
448 aa  438  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 
448 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 
457 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  51.09 
 
 
453 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 
455 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  53.38 
 
 
465 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  51.5 
 
 
453 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  51.11 
 
 
449 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 
452 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  51.05 
 
 
461 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 
455 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 
455 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  49.79 
 
 
478 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 
459 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  47.86 
 
 
452 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
453 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  49.11 
 
 
450 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 
451 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 
477 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 
453 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  48.69 
 
 
456 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 
447 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  49.11 
 
 
450 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  48.69 
 
 
456 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
454 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 
455 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 
452 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  51.53 
 
 
458 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.61 
 
 
470 aa  424  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  48.26 
 
 
446 aa  419  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  53.02 
 
 
465 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 
457 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 
467 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 
455 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  46.75 
 
 
459 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  51.53 
 
 
458 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  46 
 
 
517 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  48.69 
 
 
456 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  49.13 
 
 
464 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  49.88 
 
 
453 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  46.54 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  51.11 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  50.88 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>