More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0963 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 446 aa  910    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  53.94 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  43.98 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  44.62 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  45.85 
 
 		 470 aa  415  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  43.54 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  43.85 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  44.59 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  44.87 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  43.9 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  45.64 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  43.2 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  42.92 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  44.39 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  43.46 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  42.76 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  41.7 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  43.37 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  43.36 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  44.12 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  42.76 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  43.64 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  42.7 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  42.44 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  43.1 
 
 		 464 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  42.31 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  42.7 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  44.14 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  42.41 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 461 aa  385  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  43.71 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  43.65 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  43.81 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  42.57 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  40.97 
 
 		 451 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 449 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  43.81 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.33 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  43.91 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  43.78 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  43.11 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.11 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 460 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  43.78 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  43.71 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 		 463 aa  382  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  46.33 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  42.14 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  41.39 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  41.52 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  41.24 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  43.6 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  44.76 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  43.16 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  42.72 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  41.54 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  40.4 
 
 		 518 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  40.79 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  40.97 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>