More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3277 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  82.89 
 
 		 450 aa  755    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  73.11 
 
 		 453 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 449 aa  892    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  67.56 
 
 		 448 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  67.4 
 
 		 450 aa  601  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  65.64 
 
 		 460 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  57.84 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  56.86 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  55.56 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  55.78 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  55.56 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  55.11 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  55.11 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  57.4 
 
 		 453 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  54.97 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  56.1 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  57.36 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 448 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  54.59 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  55.38 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  56.25 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  56.96 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  55.9 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  58.81 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  57.17 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 457 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  55.35 
 
 		 489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  48.99 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  53.47 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  51.78 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  52.1 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  51.91 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  53.59 
 
 		 465 aa  461  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  53.02 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  51 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 453 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  48.27 
 
 		 520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  49.28 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  51.79 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  49.28 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  55.2 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  51.79 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  52.72 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  54.44 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  55.53 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 464 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  51.76 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 453 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  51.12 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  51.12 
 
 		 451 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  56.27 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  48.46 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  53.29 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  47.2 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  54.69 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  54.69 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  53.44 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  47.44 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  49.29 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  52.55 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  54.13 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  53.29 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  52.83 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  52.19 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  52.83 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  54.13 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  45.91 
 
 		 518 aa  425  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  52.55 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 474 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>