More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0422 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 448 aa  901    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  74.5 
 
 		 450 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  68.61 
 
 		 453 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  67.11 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  67.56 
 
 		 449 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  62.95 
 
 		 460 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  59.51 
 
 		 452 aa  524  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  55.36 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 484 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  59 
 
 		 448 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  56.17 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 458 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  55.95 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 458 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  55.95 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  56.48 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  56.17 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  52.76 
 
 		 454 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  55.29 
 
 		 453 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  56.73 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  56.92 
 
 		 462 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  54.69 
 
 		 453 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 489 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  59.03 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  55.06 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  53.32 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  52.64 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  53.66 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  53.12 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  51.32 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  54.63 
 
 		 445 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  53.81 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  52.59 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  53.47 
 
 		 451 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  51.77 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  52.22 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  50.21 
 
 		 520 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  50.75 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  52.02 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  50.75 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  49.44 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  51.1 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  48.32 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  51.56 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  51.56 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  53.66 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  52.24 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  47.26 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  48.67 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  47.58 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  52.24 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 451 aa  435  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  51.45 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 457 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  48.35 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  53.47 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  54.11 
 
 		 415 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  53.46 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  51.64 
 
 		 476 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  53.46 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  52.96 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  52.96 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  51.89 
 
 		 456 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0965  DNA repair protein RadA  53.12 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  51.61 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  51.61 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  46.8 
 
 		 518 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  51.61 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>