More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2178 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 463 aa  893    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  48.27 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  51.72 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  52.16 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  53.12 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  55.53 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  53.15 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  50.76 
 
 		 484 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  51.03 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  51.72 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  47.52 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  47.52 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  49.47 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  52.05 
 
 		 489 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  49.25 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  50.76 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  51.53 
 
 		 477 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  51.73 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  50.87 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  52.95 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  53.39 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  54.71 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  49.57 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  51.97 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  52.18 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  51.39 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  50.87 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 470 aa  415  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  51.76 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  48.64 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  51.09 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  54.08 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.64 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  54.08 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  49.31 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  49.24 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  48.92 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  47.63 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  50.76 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  51.62 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  49.24 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  49.19 
 
 		 453 aa  408  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  48.81 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.17 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  50.69 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  47.55 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  51.71 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  51.73 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  49.54 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  51.3 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  47.52 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>