More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1348 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 460 aa  930    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  55.75 
 
 		 476 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  56.64 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  56.98 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  53.88 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  53.88 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  53.74 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  53.88 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  53.88 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  53.88 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  53.66 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  53.66 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  53.88 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  53.44 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  53.44 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  52.63 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  56.55 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  52.55 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  52.17 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  51.76 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  54.37 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  52.02 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  54.18 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 448 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  52.44 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  51.57 
 
 		 450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  51.33 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  50.55 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  50.55 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  48.87 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  55.34 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  51.78 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  51.69 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 		 448 aa  441  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  51.45 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  53.13 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  48.87 
 
 		 452 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  52.74 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  49.1 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  47.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  48.22 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  48.21 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  47.51 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  47.97 
 
 		 451 aa  418  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  47.52 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  45.49 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  45.38 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  47.01 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  48.89 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  49.54 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  45.38 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  45.43 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  47.53 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  46.61 
 
 		 461 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  48.7 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  46.98 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.65 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  46.49 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  48.44 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3492  DNA repair protein RadA  46.49 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3621  DNA repair protein RadA  46.49 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  47.47 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  46.98 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>