More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0603 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 462 aa  900    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  68.07 
 
 		 475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  68.65 
 
 		 457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  67.62 
 
 		 457 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  66.37 
 
 		 473 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  65.56 
 
 		 453 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  64.43 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  68.58 
 
 		 473 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  66.14 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  65.5 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  64.65 
 
 		 454 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  65.07 
 
 		 478 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  65.09 
 
 		 498 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  63.25 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  64 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  64.14 
 
 		 483 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  60.85 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  62.06 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  62.98 
 
 		 454 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  61.56 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  55.45 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  55.16 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  54.41 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  59.03 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  59.09 
 
 		 485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  58.8 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  59.03 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  57.38 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  59.86 
 
 		 481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  58.03 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  59.31 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  55.74 
 
 		 480 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  54.36 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  54.13 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  54.13 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  49.4 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  48.97 
 
 		 495 aa  415  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  47.87 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  43.97 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  47.38 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.32 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  48.19 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  48.35 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  47.88 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  43.05 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  42.54 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  40.59 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  49.76 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  42.38 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  42.38 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.22 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.9 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.94 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  45.68 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  45.8 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  47.63 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  44.97 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.18 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  46.22 
 
 		 455 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.67 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  47.77 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.54 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  44.97 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  45.96 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.96 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  47.23 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  43.03 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  46.36 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  47.68 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  46.21 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  46.86 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  45.96 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  47.23 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.83 
 
 		 453 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>