More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1443 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 454 aa  926    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  68.5 
 
 		 455 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  68.35 
 
 		 454 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  70.02 
 
 		 457 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  69.96 
 
 		 456 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  71.99 
 
 		 457 aa  677    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  69.01 
 
 		 457 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  46.71 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.93 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  46.41 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  46.83 
 
 		 455 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  42.95 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  46.06 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  45.18 
 
 		 455 aa  405  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  44.67 
 
 		 447 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.74 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  43.53 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  43.38 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  43.64 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  46.2 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  43.64 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  43.44 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  46.41 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 456 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  43.64 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  42.29 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  46.03 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  44.96 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  43.75 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  43.45 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  42.54 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  42.48 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  47.97 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1933  DNA repair protein RadA  44.84 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0965  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  42.2 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  42.54 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  44.03 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  43.16 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  42.24 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  43.38 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  42.8 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  42.48 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1803  DNA repair protein RadA  43.98 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  47.2 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  46.51 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>