More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2458 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 450 aa  892    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  64.89 
 
 		 448 aa  610  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  45.53 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.17 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  46.21 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  48.59 
 
 		 458 aa  415  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  44.39 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  47.65 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  43.88 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  43.46 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  44.12 
 
 		 450 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  43.33 
 
 		 450 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  46.76 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  47.49 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  46.89 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  46.89 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  40.8 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  43.97 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  41.53 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  42.44 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  43.43 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.06 
 
 		 470 aa  383  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  43.85 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  42.51 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.54 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  44.12 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  41.48 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  42.73 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  43.11 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  40.45 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  43.16 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  44.79 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  42.16 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  41.5 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  41.03 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  42.57 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  41.63 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  41.33 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  43.37 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  45.69 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  40.54 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  42.95 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  42.7 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  43.29 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  42.16 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  41.41 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  39.95 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  39.14 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  41.15 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  41.15 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  41.19 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  39.23 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  39 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  38.74 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  39 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  39 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  39 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  39.77 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  42.36 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  43.33 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  40.31 
 
 		 466 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  42.13 
 
 		 466 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  39.2 
 
 		 482 aa  362  9e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  41.18 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  38 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>