More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4466 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 468 aa  921    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  68.32 
 
 		 454 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  63.83 
 
 		 475 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  64.78 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  62.88 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  62.86 
 
 		 461 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  63.83 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  61.4 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  67.29 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  60.48 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  66.01 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  61.62 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 498 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  61.44 
 
 		 468 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  61.5 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  62.44 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  60.57 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  59.87 
 
 		 449 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  62.95 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  58.96 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  59.87 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  58.06 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  57.85 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  53.58 
 
 		 467 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  56.32 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  53.46 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  54.89 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  56.67 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  57.57 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  53.38 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  53.16 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  54.65 
 
 		 460 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  53.16 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  54.35 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  55.14 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  49.36 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  49.68 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  48.94 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  48.51 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  50.89 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  47.04 
 
 		 512 aa  415  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  47.86 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  47.97 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  47.77 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  47.77 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  47.97 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 454 aa  408  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  47.77 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  46.92 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  46.92 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  43.59 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  48.64 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  43.1 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  47.56 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  43.31 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  43.1 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  50.36 
 
 		 449 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  43.1 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  45.3 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  43.1 
 
 		 458 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  43.1 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  43.64 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  43.1 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  45.18 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  45.06 
 
 		 457 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  47 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  45.4 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  45.4 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  47.36 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  42.43 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  50.93 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  44.56 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  42.43 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  42.64 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  47.32 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  47.31 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.91 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  46.71 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  47.75 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 		 451 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  45.52 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.14 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>