More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0360 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  912    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  94.3 
 
 		 457 aa  808    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  69.85 
 
 		 478 aa  600  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  68.28 
 
 		 462 aa  597  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  63.43 
 
 		 473 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  60.17 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  62.36 
 
 		 468 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  64.53 
 
 		 473 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  61.06 
 
 		 453 aa  531  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  59.83 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  64.04 
 
 		 498 aa  521  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  60.84 
 
 		 454 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  63.21 
 
 		 478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  61.87 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  63.86 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  59.62 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  56.7 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  57.76 
 
 		 485 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  57.08 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  58.84 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  55.6 
 
 		 490 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  52.36 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  56.92 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  53.15 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  56.11 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  55.79 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  55.85 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  56.62 
 
 		 481 aa  431  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  54.35 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  51.21 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  50.99 
 
 		 466 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  50.99 
 
 		 466 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  53.48 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  55.3 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  47.64 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  47.28 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  43.42 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  43.2 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  42.76 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.46 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  43.78 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 484 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  43.78 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  45.91 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  45.1 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  43.08 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 476 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  42.26 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  47.87 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  47.51 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  44.99 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  43.92 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  43.92 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  43.81 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  45.22 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 		 470 aa  382  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  44.3 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  44.57 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  43.45 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  45.49 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  44.3 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.31 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  42.92 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  41.11 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  47.96 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  47.31 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>