More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01590 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 478 aa  927    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  71.15 
 
 		 457 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  69.63 
 
 		 457 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  65.5 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  63.74 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  61.94 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  64.97 
 
 		 498 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  59.44 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  60 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  60.57 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  61.08 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  64.72 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  58.68 
 
 		 472 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  62.5 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  59.91 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  54.9 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  57.05 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  53.38 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  58.74 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  53.83 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  58.09 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  56.26 
 
 		 449 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  56.55 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  57.82 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  56.16 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  58.09 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  57.46 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  57.42 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  57.95 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  49.5 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  54.73 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  54.51 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  54.51 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  54.67 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  54.91 
 
 		 475 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  45.22 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  47.2 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  44.1 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  43.67 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  43.89 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  48.58 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  41.85 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.55 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 458 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.29 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  41.85 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  46.8 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  42.38 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  42.35 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  47.27 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  42 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  42.23 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  47.23 
 
 		 454 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  42.69 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  47.74 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  45.81 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  47.74 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  43.71 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  46.98 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  43.32 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  40.45 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  43.71 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  41.96 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0180  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  46.96 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0200  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  47.51 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  47.99 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0199  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  46.77 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  43.76 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>