More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4269 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 481 aa  932    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  96.26 
 
 		 499 aa  854    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  63.28 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  64.3 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  56.87 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  57.11 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  60.42 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  58.06 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  58.75 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  62.21 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  58.26 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  60.22 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  58.68 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  59.86 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  59.95 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  59.42 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  60.19 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  56.88 
 
 		 485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  56.3 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  56.3 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  61.01 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  58.72 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  56.53 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  57.45 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  54.39 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  58.74 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  56.16 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  56.8 
 
 		 478 aa  445  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  58.82 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  56.85 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  55.63 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  57.86 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  59.62 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  51.97 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  43.59 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  46.33 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  47.14 
 
 		 448 aa  385  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.91 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.34 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  43.32 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  43.89 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  43.36 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  42.11 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  43.26 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  44.59 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  43.02 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  43.26 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.44 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  43.26 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  43.02 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44.94 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  43.26 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  43.02 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  43.26 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  43.09 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  45.9 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  42.99 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  39.87 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  45.93 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  43.87 
 
 		 512 aa  372  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  40.48 
 
 		 457 aa  372  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  45.13 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  42.12 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  43.6 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  38.63 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  48.46 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  43.64 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  43.32 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 445 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  43.56 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  43.32 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  45.74 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  44.2 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  41.61 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  43.38 
 
 		 507 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  43.31 
 
 		 520 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  47.75 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 455 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  40.71 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  43.19 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  44.83 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  46.41 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  44.83 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>