More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2711 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 454 aa  881    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  68.53 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  74.61 
 
 		 483 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  65.88 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  64.65 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  64.94 
 
 		 466 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  65.54 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  66.51 
 
 		 473 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  63.15 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  60.84 
 
 		 457 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  61.3 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  62.16 
 
 		 473 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  64.85 
 
 		 498 aa  508  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  62.3 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  58.57 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  63.66 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  57.3 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  59.25 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  57.84 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  57.58 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  61.43 
 
 		 449 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  61.89 
 
 		 485 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  56.76 
 
 		 461 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  59.47 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  60.17 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  59.56 
 
 		 481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  59.15 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  59.12 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  57.17 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  56.5 
 
 		 460 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  57.93 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 466 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  57.93 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  57.01 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  56.64 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  45.92 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  44.07 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  46.86 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  48.2 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  48.57 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  47.53 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  50.78 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  48.86 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  49.17 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  47.79 
 
 		 484 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  45.18 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  49.88 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  43.95 
 
 		 451 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  46.23 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  47.76 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  39.24 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  50.84 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 		 408 aa  388  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  46.81 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  47.45 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  47.47 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  40.87 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  47.76 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  49.11 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  41.96 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  47.45 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  41.28 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  51.04 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  51.04 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  48.31 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>