More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13618 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 480 aa  954    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  72.21 
 
 		 462 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  72.59 
 
 		 467 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  72.59 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  72.38 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  72.38 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  59.28 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  58.73 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  60.32 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  57.33 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  55.86 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  54.3 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  54.36 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  54.77 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  52.4 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  56.91 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 478 aa  438  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  56.62 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  55.63 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  55.35 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  51.79 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  56.64 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  55 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  51.79 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  52.43 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  54.63 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  55.19 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  53.88 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  52.69 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  54.32 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  54.12 
 
 		 473 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  54.99 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 465 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  46.18 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  42.38 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  41.94 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  46.11 
 
 		 495 aa  382  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  52.43 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  42.67 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.24 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  41.58 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  41.58 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  41.58 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  41.58 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  41.79 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  41.58 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  41.58 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.76 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  40.92 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  39.74 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  43.85 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  45.33 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  45.22 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  44.79 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  42.69 
 
 		 453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  45.8 
 
 		 467 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 		 408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  44.59 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  43.61 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  42.09 
 
 		 456 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  42.58 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  45.06 
 
 		 415 aa  358  8e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 449 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  41.63 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  41.63 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 453 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  41 
 
 		 454 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  44.1 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 456 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  41 
 
 		 457 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 452 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 451 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 448 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  41.28 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  38.85 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  45.1 
 
 		 454 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  45.23 
 
 		 466 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  40.79 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  41.05 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  40.04 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>