More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0228 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 460 aa  887    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  60.28 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  58.87 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  55.86 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  58.03 
 
 		 462 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  56.11 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  57.55 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  55.68 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  54.32 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  54.65 
 
 		 468 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  59.29 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  52.83 
 
 		 472 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  53.96 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  58.57 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  57.95 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  54.08 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  55.43 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  56.4 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  50.68 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  48.11 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  56.91 
 
 		 498 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  54.25 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  56.05 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  48.24 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  53.19 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.76 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  53.47 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  52.03 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 448 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.67 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  48.59 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  47.92 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.84 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  47.92 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  45.78 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.53 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  51.97 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.52 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  44.95 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  52.2 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.93 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.54 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  41.31 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  51.77 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  42.35 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.13 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  42.13 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  44.32 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  42.24 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.92 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  41.91 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  41.91 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  45.21 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  46.17 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  41.15 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  41.91 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  40.79 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  41.91 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  41.15 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  45.72 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  41.46 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  46.1 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  48.55 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  42.32 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  41.37 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.28 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  40.04 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  40.04 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  40.35 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  43.36 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  43.67 
 
 		 481 aa  364  1e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  40.57 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  45.29 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.18 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.57 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  40.57 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  44.57 
 
 		 451 aa  363  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  45.07 
 
 		 453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  44.2 
 
 		 482 aa  362  6e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  43.44 
 
 		 512 aa  362  8e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.83 
 
 		 453 aa  362  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  39.82 
 
 		 457 aa  362  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  43.61 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>