More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0150 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 465 aa  920    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  63.28 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  63.07 
 
 		 499 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  59.03 
 
 		 462 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  57.24 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  60.27 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  57.64 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  57.49 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  55.97 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  54.56 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  57.68 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  58.8 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  56.6 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  56.22 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  53.54 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  61.18 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  53.76 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  56.11 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  59.15 
 
 		 473 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  55.51 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  57.77 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  57.87 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  55.07 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  54.05 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  55.44 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  54.64 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  58.28 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  56.61 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  54.43 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  54.43 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  54.6 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  54.81 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  53.04 
 
 		 480 aa  412  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  47.06 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  52.64 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.51 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.55 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  45.59 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  40.79 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  44.62 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  43.2 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  44.87 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  41.96 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  41.96 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.03 
 
 		 453 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  47.23 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  48.37 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  42.39 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  42.64 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  42.64 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  42.64 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  40.26 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  42.64 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  46.83 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  42.57 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  45.53 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.65 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.49 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.45 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.63 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  47.48 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  48.75 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  43.76 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  48.03 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  41.43 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  45.85 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  44.66 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  48.07 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  43.54 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  46.72 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  42.23 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  44 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0262  DNA repair protein RadA  47.19 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  47.85 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  43.82 
 
 		 464 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  44.84 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  43.48 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>