More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3279 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 478 aa  928    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  66.89 
 
 		 473 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  63.12 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  65.73 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  67.28 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  60.39 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  61.05 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  61.62 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  63.12 
 
 		 475 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  60.96 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  58.89 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  60.96 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  58.95 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  61.43 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  60.31 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  56.39 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  60.78 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  54.44 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  59.1 
 
 		 454 aa  465  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  58.19 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  57.71 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  57.49 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  57.49 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  58.18 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  57.78 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  56.54 
 
 		 485 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  59.29 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  57.21 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  56.55 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  55.89 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  50.6 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  55.48 
 
 		 475 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  49.17 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  59.3 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  58.35 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.46 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  45.54 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.19 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.76 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  43.61 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.43 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  45.29 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  41.09 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  47.11 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  39.6 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.28 
 
 		 457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 454 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 454 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 		 448 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  40.53 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  40.31 
 
 		 457 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  38.98 
 
 		 446 aa  356  5e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  41.71 
 
 		 446 aa  356  5.999999999999999e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  42.09 
 
 		 449 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  38.8 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  40.97 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  38.5 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  38.9 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 476 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  39.2 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 458 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 		 456 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  40.75 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  38.78 
 
 		 507 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  41.87 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  41.87 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  47.91 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  47.72 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  39.91 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  39.47 
 
 		 458 aa  349  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 458 aa  349  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 		 458 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  40.76 
 
 		 446 aa  348  8e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  42.36 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  41.37 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  42.57 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.37 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  39.24 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>