More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1747 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 512 aa  1034    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  62.31 
 
 		 495 aa  630  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  51.68 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  51 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  48.31 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  49.4 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  50.6 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  49.5 
 
 		 478 aa  422  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  50.32 
 
 		 473 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  48.21 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  46.55 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  46.38 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  48.34 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  46.63 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  46.35 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  48.91 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  45.85 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  47.58 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  45.33 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  47.2 
 
 		 480 aa  379  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  39.42 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  46.21 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  44.31 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  40.47 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  39.33 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 		 454 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  40.59 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  40.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  40.59 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  40.08 
 
 		 458 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  39.88 
 
 		 458 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  40.23 
 
 		 462 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  37.74 
 
 		 457 aa  362  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 449 aa  362  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 475 aa  362  8e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  40.12 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  46.11 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  40.67 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  39.35 
 
 		 482 aa  360  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  39.88 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  41.34 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  40 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  43.44 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  39.73 
 
 		 481 aa  359  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  39.88 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  40.67 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  40.37 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  40.62 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  42.95 
 
 		 450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  41.52 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  44.38 
 
 		 449 aa  356  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  40.2 
 
 		 456 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  38.82 
 
 		 454 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  41.82 
 
 		 449 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  40.2 
 
 		 456 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  38.82 
 
 		 454 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  41.22 
 
 		 456 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  41.26 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  43.87 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  40.2 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  40.43 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  40.62 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  38.59 
 
 		 451 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  43.48 
 
 		 481 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  45.36 
 
 		 483 aa  353  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  40.24 
 
 		 456 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  42.2 
 
 		 445 aa  352  8e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  40 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  38.75 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  40.12 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  39.64 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  36.86 
 
 		 460 aa  348  9e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  38.82 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  40.43 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  40.63 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  36.91 
 
 		 448 aa  347  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  39.21 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  38.05 
 
 		 457 aa  346  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  40.55 
 
 		 458 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  42.54 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  37.96 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  39.88 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  40.74 
 
 		 458 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  36.15 
 
 		 452 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>