More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0566 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 473 aa  912    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  73.42 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  68.23 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  69.57 
 
 		 498 aa  571  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  67.53 
 
 		 453 aa  558  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  64.59 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  65.19 
 
 		 475 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  63.97 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  66.37 
 
 		 478 aa  531  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  63.47 
 
 		 457 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  62.78 
 
 		 461 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  64.86 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  62.68 
 
 		 466 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  62.25 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  62.77 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  61.7 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  63.35 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  59.06 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  60.18 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  59.45 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  61.25 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  59.32 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  55 
 
 		 461 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  59.42 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  60.17 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  53.93 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  53.81 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  57.92 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  57.34 
 
 		 460 aa  438  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  57.59 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  49.4 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  54.19 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  53.96 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  56.28 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  53.96 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  53.9 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  42.62 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  42.44 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  42 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.39 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  42 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  43.14 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.09 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  43.68 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  48.08 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  40.87 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.7 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  42.44 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  41.87 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  41.74 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  39.86 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  41.74 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  40.81 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  48.65 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  48.42 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.1 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 454 aa  372  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  45.9 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  45.78 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  48.53 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  48.42 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  45.9 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.84 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.22 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.29 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  45.76 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  47.14 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  46.08 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  41.69 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  46.5 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  42.5 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  45.54 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1933  DNA repair protein RadA  47.96 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  46.79 
 
 		 455 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>