More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0397 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 498 aa  959    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  72.98 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  69.89 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  64.58 
 
 		 453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  64.74 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  58.37 
 
 		 475 aa  538  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  66.52 
 
 		 478 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  61.72 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  64.04 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  61.64 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  64.5 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  59.61 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  59.33 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  59.27 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  63.76 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  58.44 
 
 		 461 aa  491  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  59.86 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  51.68 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  58.48 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  55.88 
 
 		 461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  59.17 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  55.56 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  60.6 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  54.74 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  58.81 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  56.76 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  56.95 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  49.4 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  56.35 
 
 		 499 aa  445  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  56.73 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  56.73 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  58.19 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  54.58 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  56.32 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  56.91 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  54.14 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  47.51 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  44.95 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  45.42 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  42.46 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  42.12 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.91 
 
 		 462 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  47.64 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.73 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  45.52 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0199  DNA repair protein RadA  50.43 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  41.68 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  48.19 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0180  DNA repair protein RadA  50.43 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  47.21 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  45.72 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  47.31 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  45.53 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  41.25 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  41.25 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.63 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  47.84 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  42.24 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  44.8 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1933  DNA repair protein RadA  47.75 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  46.77 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  40.95 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  46.38 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  40.43 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  46.79 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  43.25 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  45.11 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  44.99 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  46.96 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  45.11 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  39.1 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  45.96 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  46.35 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>