More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0645 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 449 aa  869    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  63.25 
 
 		 462 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  64.13 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  59.87 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  61.66 
 
 		 475 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  62.42 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  61.66 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  60.8 
 
 		 454 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  59.73 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  57.56 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 467 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  60.78 
 
 		 490 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  60.71 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  58.11 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  60.31 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  61.7 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  59.68 
 
 		 483 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  55.23 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  59.42 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  54.63 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  56.47 
 
 		 457 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  60.6 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  58.72 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  58.13 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  55.82 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  54.77 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  54.08 
 
 		 466 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  57.81 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  58.78 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  53.86 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  53.86 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  57.21 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  56.4 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  48.24 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  42.48 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  45.21 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  47.51 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.79 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.57 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.15 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  46.84 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  49.29 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  47.65 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  45.11 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  42.35 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  42.26 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  48.24 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  44.15 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  41.81 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  41.59 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  41.81 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.04 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.81 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  41.59 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  41.81 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  43.81 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  41.81 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  41.46 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  47.42 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  49.54 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  41.37 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  41.86 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  44.81 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  44.38 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  45.91 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  45.91 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0199  DNA repair protein RadA  49.2 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  48.38 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0200  DNA repair protein RadA  47.74 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  46.75 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0180  DNA repair protein RadA  49.2 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  42.06 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  40.17 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 454 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  47.81 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  49.09 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  47.95 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  38.32 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  47.68 
 
 		 455 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  41.72 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.15 
 
 		 451 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  47.53 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  39.64 
 
 		 454 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  39.64 
 
 		 454 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  43.22 
 
 		 481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 458 aa  362  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>