More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0359 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 490 aa  934    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  79.55 
 
 		 485 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  62.61 
 
 		 449 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  61.42 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  58.8 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  60.81 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  60.32 
 
 		 475 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  56.7 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  55.41 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  59.45 
 
 		 468 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  60.48 
 
 		 454 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  57.92 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  56.45 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  60.75 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  59.73 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  55.85 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  58.68 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  57.08 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  55.8 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  56.53 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  58.55 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  59.36 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  57.82 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  56.12 
 
 		 499 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  55.43 
 
 		 466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  55.22 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  56.3 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  56.24 
 
 		 465 aa  445  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  55.22 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  58.52 
 
 		 498 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  54.47 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  53.76 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  56.08 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 484 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  42.4 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.17 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  43.38 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  42.77 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.64 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  42.77 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  43.81 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  42.41 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  47.81 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  47.96 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  43.55 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  42.41 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  45.06 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  47.71 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  41.16 
 
 		 454 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  45.06 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  46.52 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  42.2 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  42.17 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  42.2 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  45.62 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  41.04 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  41.44 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  42.2 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 451 aa  362  6e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 451 aa  362  6e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.1 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  44.3 
 
 		 455 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 518 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  41.98 
 
 		 458 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  41.8 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.98 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  47.17 
 
 		 466 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  42.41 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  47.17 
 
 		 466 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  42.37 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  45.47 
 
 		 455 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  44.3 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  41.22 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>