58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0998 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  96.52 
 
 
230 aa  454  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  94.35 
 
 
230 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  93.04 
 
 
230 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  65.65 
 
 
230 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  37.5 
 
 
231 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  37.89 
 
 
229 aa  181  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  29.24 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  28.46 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  29.29 
 
 
252 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  27.73 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  28.88 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  31.9 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  26.11 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  26.81 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  27.06 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  26.46 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  26.46 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  27.19 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  25 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  32.05 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  27.72 
 
 
457 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  32.89 
 
 
277 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  32.89 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  32.05 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  31.43 
 
 
295 aa  48.9  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  27.81 
 
 
470 aa  48.5  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2630  DNA repair protein RadA  26.72 
 
 
470 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
458 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 
458 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 
458 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 
494 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  25.45 
 
 
447 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  27.1 
 
 
458 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1685  DNA repair protein RadA  25.33 
 
 
466 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  34.29 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  25.45 
 
 
447 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  26.72 
 
 
484 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0695  DNA repair protein RadA  23.27 
 
 
450 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  27.87 
 
 
563 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  25 
 
 
562 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  28 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  28 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  25 
 
 
408 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  27.78 
 
 
457 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  26.47 
 
 
457 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  26.38 
 
 
415 aa  42  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  26.83 
 
 
457 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  23.41 
 
 
461 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>