30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2567 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  75.71 
 
 		 253 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  72.91 
 
 		 253 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  74.09 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  50.83 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  36.86 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  35.86 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  32.07 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  31.22 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  29.24 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  29.66 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  29.11 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  27.47 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  25.74 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  25.48 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  28.18 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  22.75 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  26.8 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  23.17 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  24.12 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  37.14 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  39.39 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  26.03 
 
 		 484 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  35.44 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  33.78 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  38.46 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.49 
 
 		 498 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  23.85 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  20.24 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.76 
 
 		 452 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>