72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1343 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  100 
 
 
244 aa  503  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  80.26 
 
 
244 aa  400  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  76.15 
 
 
247 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  65.15 
 
 
256 aa  350  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  55.17 
 
 
238 aa  289  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  44.25 
 
 
262 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  36.24 
 
 
234 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  32.75 
 
 
227 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  28.64 
 
 
231 aa  95.5  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  27.4 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  26.81 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  26.81 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  25.74 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  25.52 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  26.38 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  26.38 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  23.65 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  23.11 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  21.2 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  33.33 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  26.05 
 
 
504 aa  65.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  24.69 
 
 
514 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  29 
 
 
267 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  25.45 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  27.01 
 
 
483 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  24.48 
 
 
510 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  31 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  24.29 
 
 
510 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  22.06 
 
 
474 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  28 
 
 
277 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
480 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  25.41 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  31.52 
 
 
482 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  31.71 
 
 
498 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  24.64 
 
 
575 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  23.08 
 
 
507 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  24.35 
 
 
492 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  24.64 
 
 
575 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  23.08 
 
 
507 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  25.22 
 
 
567 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  26.09 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  23.53 
 
 
506 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  27.05 
 
 
562 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  30.95 
 
 
480 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  23.04 
 
 
494 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  31.58 
 
 
262 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  26.77 
 
 
481 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  28.24 
 
 
301 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  32.14 
 
 
501 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  23.56 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  23.7 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  35.53 
 
 
496 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 
461 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  24.2 
 
 
518 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  22.08 
 
 
519 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  22.62 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 
504 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.57 
 
 
498 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  27.16 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 
500 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  26.95 
 
 
453 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  20.43 
 
 
484 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  21.91 
 
 
512 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  21.2 
 
 
512 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  19.64 
 
 
482 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  23.32 
 
 
512 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  22.69 
 
 
509 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  22.05 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  24.17 
 
 
575 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  22.9 
 
 
532 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  22.32 
 
 
520 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  30.34 
 
 
505 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>