50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1733 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  94.35 
 
 		 230 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  95.65 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  91.74 
 
 		 230 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  64.35 
 
 		 230 aa  310  9e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  37.95 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  36.56 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  32.07 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  30.54 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  27.67 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  26.89 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  30.3 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  25.79 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  26.81 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  25.69 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  30.17 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  26.09 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  26.01 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  24.38 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  25.88 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  32.05 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  26.71 
 
 		 457 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  31.58 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 		 458 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 		 458 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 		 458 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  28.48 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 		 458 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  28.48 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  26.67 
 
 		 470 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 		 458 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  25.15 
 
 		 458 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  28.48 
 
 		 458 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  27.11 
 
 		 447 aa  45.4  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  25.15 
 
 		 458 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  25.15 
 
 		 458 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2630  DNA repair protein RadA  25.19 
 
 		 470 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0695  DNA repair protein RadA  23.86 
 
 		 450 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  35.29 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  27.63 
 
 		 458 aa  42.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  27.39 
 
 		 457 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  25.88 
 
 		 494 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  26.72 
 
 		 484 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.23 
 
 		 563 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  27.78 
 
 		 460 aa  42  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  26.54 
 
 		 457 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>