86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0950 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  100 
 
 		 247 aa  512  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  76.15 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  77.16 
 
 		 244 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  66.11 
 
 		 256 aa  337  8e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  56.96 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  41.04 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  34.5 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  30.13 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  28.51 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  27.98 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  25.48 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  27.54 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  24.38 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  25 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  24.58 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  25.85 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  24 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  24.89 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  24.89 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  28.17 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  33.33 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.58 
 
 		 483 aa  55.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 492 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  24.79 
 
 		 504 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  23.15 
 
 		 484 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  25.32 
 
 		 514 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  24.31 
 
 		 518 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  22.77 
 
 		 482 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  21.05 
 
 		 474 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  26.56 
 
 		 498 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  23.83 
 
 		 494 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  26.45 
 
 		 565 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 		 480 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  29.1 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  30.38 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  24.43 
 
 		 482 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  22.69 
 
 		 488 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  24.78 
 
 		 567 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  24.66 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  24.55 
 
 		 479 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.86 
 
 		 498 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  24.53 
 
 		 575 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  24.53 
 
 		 575 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 504 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  20.37 
 
 		 510 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  23.56 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  24.07 
 
 		 496 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  24.89 
 
 		 506 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  30.12 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  22.84 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  24.2 
 
 		 507 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  22.32 
 
 		 563 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  24.2 
 
 		 507 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  20.37 
 
 		 510 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  27.5 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  24.63 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  24.63 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  22.69 
 
 		 512 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  23.28 
 
 		 521 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 528 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  23.28 
 
 		 521 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  28.92 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  24.14 
 
 		 497 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  22.69 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  31.58 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  22.22 
 
 		 512 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  24.38 
 
 		 508 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  22.36 
 
 		 519 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  28.92 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  22.43 
 
 		 494 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  23.81 
 
 		 501 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  21.36 
 
 		 500 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  21.66 
 
 		 509 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 509 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 498 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 509 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 500 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 500 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 512 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  33.33 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  28.23 
 
 		 501 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  21.78 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 344 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  21.76 
 
 		 519 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  20.97 
 
 		 434 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  21.3 
 
 		 520 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>