More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2176 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 434 aa  849    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1656  DNA repair protein RadA  75.34 
 
 		 438 aa  617  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353254  normal  0.473589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  61 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  45.65 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  44.83 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  44.13 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  43.39 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  45.67 
 
 		 470 aa  362  8e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  43.92 
 
 		 455 aa  362  9e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  43.19 
 
 		 454 aa  362  9e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  43.19 
 
 		 454 aa  362  9e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  45.69 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 466 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  43.19 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  45.07 
 
 		 448 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  44.03 
 
 		 458 aa  359  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  358  7e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  47.21 
 
 		 457 aa  359  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  44.15 
 
 		 450 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.76 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  43.56 
 
 		 458 aa  354  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  45.07 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 458 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.84 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  44.03 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  42.62 
 
 		 457 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  45.67 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  44.03 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  43.09 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  42.39 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  47.64 
 
 		 447 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  44.26 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.26 
 
 		 451 aa  350  4e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  42.46 
 
 		 446 aa  349  7e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 451 aa  348  8e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  41.06 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  41.57 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  41.3 
 
 		 446 aa  348  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  44.24 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  43.28 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  47.21 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  43.15 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  42.04 
 
 		 455 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  44.19 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 452 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 452 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  45.5 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  46.81 
 
 		 460 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  42.99 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  42.99 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  43.46 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  47.44 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  43.96 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 456 aa  342  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  42.23 
 
 		 446 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 		 463 aa  342  7e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 		 463 aa  342  7e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  44.06 
 
 		 461 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  45.62 
 
 		 464 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  42.06 
 
 		 514 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  42.69 
 
 		 448 aa  341  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  40 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  42.06 
 
 		 514 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  44.55 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  43.71 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  40.72 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>