More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0255 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  60.47 
 
 
265 aa  310  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  38.49 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  39.25 
 
 
267 aa  178  9e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  38.55 
 
 
295 aa  175  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  38.64 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  38.66 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  39.41 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  38.66 
 
 
242 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  38.66 
 
 
242 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  33.82 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  36.12 
 
 
285 aa  135  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  33.05 
 
 
293 aa  129  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  34.8 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  33.19 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  35.68 
 
 
280 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  29.91 
 
 
229 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  32.94 
 
 
512 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  27.98 
 
 
506 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  28.26 
 
 
514 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  29.73 
 
 
402 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  30.36 
 
 
344 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  33.49 
 
 
488 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  31.76 
 
 
512 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  26.75 
 
 
507 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  31.5 
 
 
509 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  26.75 
 
 
507 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  28.05 
 
 
510 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  31.5 
 
 
498 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  33.07 
 
 
519 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  31.89 
 
 
528 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  30.98 
 
 
519 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
362 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  31.1 
 
 
509 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  32.68 
 
 
514 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.18 
 
 
510 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  30.89 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  32.57 
 
 
509 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  33.79 
 
 
232 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  33.03 
 
 
512 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  31.14 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  32.16 
 
 
519 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  33.03 
 
 
500 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  32.94 
 
 
520 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  29.28 
 
 
285 aa  94  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  29.63 
 
 
364 aa  94  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  32.57 
 
 
500 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  32.76 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  29.03 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  31.76 
 
 
521 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  31.76 
 
 
521 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 
472 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  31.39 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  28.35 
 
 
518 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  30.04 
 
 
280 aa  89  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  30.21 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  31.51 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  26.73 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  29.63 
 
 
281 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  28.51 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.69 
 
 
504 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  29.22 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  27.98 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  28.75 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  27.71 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  27.31 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  27.34 
 
 
509 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  30.04 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
480 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  30.47 
 
 
550 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.46 
 
 
459 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  28.93 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  26.42 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  24.71 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.53 
 
 
505 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 
484 aa  78.6  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  27.39 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  25.74 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  26.77 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  25.57 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  26.29 
 
 
584 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 
491 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  28.5 
 
 
505 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  28.1 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.39 
 
 
498 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.7 
 
 
497 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  27.16 
 
 
494 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.7 
 
 
574 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.45 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  27.43 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  30.86 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  27.43 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  25.76 
 
 
502 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.02 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  27.56 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  27.62 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>