272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0879 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  49.79 
 
 
235 aa  236  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  41.03 
 
 
241 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  30.25 
 
 
301 aa  90.1  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  26.67 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  29.44 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  29.91 
 
 
550 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  26.69 
 
 
267 aa  79  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  27.69 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  26.49 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  26.77 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  44.83 
 
 
584 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  27.55 
 
 
271 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  25.83 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  43.68 
 
 
574 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  25.52 
 
 
242 aa  72  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  25.52 
 
 
242 aa  72  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  26.27 
 
 
518 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  25.64 
 
 
535 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  40.23 
 
 
569 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  26.94 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  26.38 
 
 
509 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  31.82 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  25.51 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  26.61 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  27 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.73 
 
 
498 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  27.59 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  25.88 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  29.91 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  36.73 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  38.2 
 
 
500 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  38.2 
 
 
488 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 
560 aa  65.1  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  22.71 
 
 
454 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  24.46 
 
 
559 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  29.13 
 
 
482 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  24.57 
 
 
489 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  39.33 
 
 
498 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.44 
 
 
496 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  34.74 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  38.2 
 
 
500 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  40.96 
 
 
567 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  26.97 
 
 
506 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  39.33 
 
 
512 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  39.73 
 
 
492 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  38.2 
 
 
509 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.85 
 
 
573 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.53 
 
 
574 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  38.2 
 
 
509 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  25.43 
 
 
519 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  40.96 
 
 
562 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  39.33 
 
 
512 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  27.16 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  25.63 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  37.08 
 
 
509 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 
498 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 
494 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  24.36 
 
 
459 aa  62.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 
497 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  37.08 
 
 
512 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  24.78 
 
 
528 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  39.77 
 
 
565 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  38.2 
 
 
519 aa  62  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  29.03 
 
 
570 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  35.96 
 
 
496 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  23.58 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  27.69 
 
 
505 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
504 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  39.33 
 
 
519 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  26.58 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  27.66 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
520 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 
507 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  24.14 
 
 
494 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  25.22 
 
 
520 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  26.86 
 
 
402 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  27.69 
 
 
520 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  39.02 
 
 
575 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  39.02 
 
 
575 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0822  signal transduction ATPase  24.78 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.552879  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  27.27 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  33.63 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
502 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  37.21 
 
 
521 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  27.08 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  37.21 
 
 
521 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  32.12 
 
 
563 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  28.24 
 
 
434 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  24.05 
 
 
472 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
504 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  24.18 
 
 
283 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  26.55 
 
 
502 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  26.23 
 
 
497 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  28.7 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  31.39 
 
 
562 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  24.47 
 
 
532 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  34.41 
 
 
514 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  24.05 
 
 
281 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>