158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1563 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  32.88 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  32.88 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  35.71 
 
 		 259 aa  88.2  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  32.2 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  28.27 
 
 		 550 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  32.88 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  31.51 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  34.03 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  32.64 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  34.01 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  36 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  32.65 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  41.49 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  36.81 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  36.11 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  34.13 
 
 		 528 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  32.26 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  32.54 
 
 		 519 aa  72  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  37.93 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  31.25 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  37.18 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30.45 
 
 		 570 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  38.89 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  29.86 
 
 		 500 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  25.84 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  29.86 
 
 		 500 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 		 507 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 		 507 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  26.21 
 
 		 584 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  30.56 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  29.03 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  28.47 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  28.47 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  31.97 
 
 		 519 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  29.17 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  29.17 
 
 		 509 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  28.47 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  27.78 
 
 		 512 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  27.59 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.17 
 
 		 512 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  27.78 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  24.8 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  46.38 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  33.98 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  34.74 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  35.48 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  32.97 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  31.72 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.81 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  40.91 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  33.06 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  31.45 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  31.45 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  36.14 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25.64 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  31.25 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  37.21 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  33.72 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  33.9 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  35.29 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  34.67 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  29.48 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  32.94 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  33.33 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  26.84 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.12 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  27.47 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  27.47 
 
 		 575 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  26.43 
 
 		 362 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3193  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  23.53 
 
 		 336 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  32.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  26.37 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  27.75 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  30.28 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  29.58 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  29.58 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  35.9 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  36.36 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  27.47 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  26.13 
 
 		 569 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  32.65 
 
 		 484 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  28.87 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 562 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.61 
 
 		 563 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 503 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  26.57 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  26.9 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  39.02 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  30.43 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.42 
 
 		 575 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 503 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  26.92 
 
 		 567 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  41.43 
 
 		 532 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  33.73 
 
 		 467 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.73 
 
 		 498 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  22.82 
 
 		 559 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>