57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3193 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3193  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  100 
 
 
336 aa  679    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  28.12 
 
 
242 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  28.12 
 
 
242 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  25.1 
 
 
494 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  30.25 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  32.22 
 
 
281 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  35.56 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  35.56 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  25.82 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  32.22 
 
 
283 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  23.53 
 
 
237 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  23.42 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  34.31 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  27.94 
 
 
344 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  28.16 
 
 
506 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  27 
 
 
514 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  27.78 
 
 
512 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.78 
 
 
488 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  27.64 
 
 
472 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  27.78 
 
 
512 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  30.67 
 
 
514 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  27 
 
 
507 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  27 
 
 
507 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.93 
 
 
510 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  26.43 
 
 
509 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  30 
 
 
224 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
498 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  25.56 
 
 
519 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
518 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  24.3 
 
 
519 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  26.58 
 
 
232 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  22.5 
 
 
259 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  34.67 
 
 
271 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  27.4 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  23.33 
 
 
521 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  23.33 
 
 
521 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  24 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  20.75 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.67 
 
 
528 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  22.22 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  23.33 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  25.56 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  25.58 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  21.78 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  24.26 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  24.74 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  32.47 
 
 
498 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 
461 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  25 
 
 
519 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 
267 aa  43.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  24.68 
 
 
454 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  22.67 
 
 
509 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  22.67 
 
 
498 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  26.09 
 
 
510 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  22.67 
 
 
509 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>