More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1339 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 446 aa  904    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 446 aa  904    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  97.31 
 
 		 446 aa  880    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  71.14 
 
 		 447 aa  653    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  76.68 
 
 		 446 aa  724    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  84.3 
 
 		 446 aa  746    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  75.34 
 
 		 446 aa  723    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  73.32 
 
 		 446 aa  698    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  66.67 
 
 		 450 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  60.85 
 
 		 448 aa  578  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.47 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  46.46 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  47.8 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  47.18 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.8 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.22 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  46.76 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  46.99 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  45.72 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.36 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  46.99 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  48.47 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  44.16 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 448 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  46.52 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  47.41 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.31 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  45.19 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  45.94 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  47.43 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  44.77 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  46.46 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  44.79 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  44.84 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  45.88 
 
 		 453 aa  378  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  44.99 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  45.87 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  45.98 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  43.51 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  43.51 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  45.5 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  46.46 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  45.09 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  46.79 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  44.23 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  44.5 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  45.18 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  45.09 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  47.43 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  45.69 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  47.43 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  43.39 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  43.01 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  45.9 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  44.5 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  45.78 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  42.05 
 
 		 518 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>