231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1841 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  331  3e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  87.2 
 
 		 392 aa  283  5.999999999999999e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  64.2 
 
 		 394 aa  210  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  34.78 
 
 		 380 aa  78.2  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  35.67 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  34.97 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  34.78 
 
 		 380 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  35 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  34.29 
 
 		 335 aa  68.2  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  33.09 
 
 		 333 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  30.94 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  31.21 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  29.79 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  33.56 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  28.17 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  26.8 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  30.46 
 
 		 463 aa  54.7  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  34.68 
 
 		 570 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  27.27 
 
 		 345 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  28.17 
 
 		 341 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  33.87 
 
 		 570 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  28.95 
 
 		 454 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  28.95 
 
 		 454 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  25.17 
 
 		 378 aa  52.4  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  31.75 
 
 		 448 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  26.09 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  28.95 
 
 		 457 aa  52  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  29.82 
 
 		 455 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  33.04 
 
 		 338 aa  50.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 501 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  31.54 
 
 		 443 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 498 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  23.61 
 
 		 360 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  32.38 
 
 		 482 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  31.39 
 
 		 453 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  31.43 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  25.53 
 
 		 373 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  29.46 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  33.93 
 
 		 482 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  29.36 
 
 		 563 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 		 492 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  30.67 
 
 		 452 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  41.54 
 
 		 496 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  26.27 
 
 		 454 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 		 560 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  34.41 
 
 		 455 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1685  DNA repair protein RadA  29.13 
 
 		 466 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  30.77 
 
 		 462 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  26.49 
 
 		 453 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  30.65 
 
 		 450 aa  47.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  30.65 
 
 		 450 aa  47.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  30.43 
 
 		 454 aa  47.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  29.31 
 
 		 446 aa  47.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  25.33 
 
 		 454 aa  47.4  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  35.58 
 
 		 474 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 463 aa  47.4  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  31.34 
 
 		 434 aa  47.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  31.03 
 
 		 475 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  24.54 
 
 		 504 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  26.61 
 
 		 565 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  32.61 
 
 		 467 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1226  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  34.34 
 
 		 574 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  27.1 
 
 		 463 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  33.73 
 
 		 483 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  32.99 
 
 		 480 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  26.67 
 
 		 457 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  32.61 
 
 		 467 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  32.71 
 
 		 465 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 461 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  31.48 
 
 		 497 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  29.91 
 
 		 464 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  33.7 
 
 		 476 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  27.21 
 
 		 456 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  27.81 
 
 		 461 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  30.17 
 
 		 466 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  31.13 
 
 		 575 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  31.13 
 
 		 575 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  32.11 
 
 		 462 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  31.9 
 
 		 562 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  28.83 
 
 		 408 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.36 
 
 		 575 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  25.95 
 
 		 446 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  30.43 
 
 		 464 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  34.41 
 
 		 453 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  31.78 
 
 		 462 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  27.93 
 
 		 453 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  25.95 
 
 		 446 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  29.91 
 
 		 453 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3219  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 462 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  27.21 
 
 		 456 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  31.31 
 
 		 454 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  30.17 
 
 		 453 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  32.53 
 
 		 505 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>