30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1788 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  89.72 
 
 		 360 aa  201  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  87.85 
 
 		 378 aa  194  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  73 
 
 		 362 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  66.33 
 
 		 373 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  39.18 
 
 		 380 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  33.01 
 
 		 380 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  30 
 
 		 380 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  33.67 
 
 		 380 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  31.46 
 
 		 394 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  26.09 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  26.37 
 
 		 392 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  35.48 
 
 		 339 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  34.78 
 
 		 464 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  35.16 
 
 		 333 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  31.25 
 
 		 411 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  32.22 
 
 		 341 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  32.41 
 
 		 448 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  24.65 
 
 		 453 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  52.78 
 
 		 326 aa  43.5  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  34.44 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  38.78 
 
 		 357 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  30.77 
 
 		 351 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  34.34 
 
 		 449 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  29.67 
 
 		 345 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  30.56 
 
 		 462 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  51.43 
 
 		 334 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  30.68 
 
 		 360 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1105  DNA repair protein RadA  28.04 
 
 		 462 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.210727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>