34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1843 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  100 
 
 		 333 aa  679    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  86.77 
 
 		 326 aa  588  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  51.65 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  50.75 
 
 		 334 aa  358  6e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  38.46 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  39.06 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  35.65 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  32.24 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  33.52 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  31.41 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  34.22 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  30.77 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  32.07 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  34.57 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  32.57 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  28.5 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  33.09 
 
 		 164 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  28.5 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  28.99 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  25.97 
 
 		 454 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  25.69 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  35.16 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  25.36 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  39.39 
 
 		 496 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  25.86 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  25.86 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  25.56 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  24.86 
 
 		 455 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  26.01 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  44.68 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  28.33 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  25.54 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  37.04 
 
 		 463 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>