61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0855 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  100 
 
 		 362 aa  735    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  59.62 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  56.47 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  51.14 
 
 		 373 aa  360  2e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  51.95 
 
 		 226 aa  230  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  74.23 
 
 		 143 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  30.98 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  29.55 
 
 		 380 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  30.03 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  34.13 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  30.36 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  30.77 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  30.17 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  28.4 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  29.79 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  29.11 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  25.09 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  30.18 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  25.2 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  24.8 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  30.56 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.09 
 
 		 563 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  28.61 
 
 		 584 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  26.55 
 
 		 560 aa  52.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  26.45 
 
 		 562 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  25.63 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  25.91 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  28.74 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  25.99 
 
 		 510 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  24.72 
 
 		 499 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  26.24 
 
 		 161 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.65 
 
 		 482 aa  49.7  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 461 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.08 
 
 		 575 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  25.19 
 
 		 567 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25.64 
 
 		 550 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  24.18 
 
 		 357 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  27.07 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  24.63 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  25.93 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  26.24 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  24.55 
 
 		 574 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  23.59 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  26.35 
 
 		 573 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  24.36 
 
 		 500 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  26.04 
 
 		 575 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  26.04 
 
 		 575 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  24.64 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  23.72 
 
 		 504 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  26.45 
 
 		 532 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  23.91 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  23.75 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  23.08 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  25.81 
 
 		 570 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  23.75 
 
 		 509 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  25.78 
 
 		 480 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  27.14 
 
 		 569 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  23.75 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  25.82 
 
 		 501 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  26.09 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>