298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1279 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  783    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  66.24 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  87.2 
 
 		 164 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1839  hypothetical protein  70.42 
 
 		 72 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478865  hitchhiker  0.000656033 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  34.97 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  35.98 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  32.93 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  32.32 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  35.29 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  32.95 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  32.57 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  26.04 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  31.09 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  28.4 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  30.86 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  28.31 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  28.31 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  29.65 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  30.48 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  28.14 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  23.43 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  28.18 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  27.62 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  28.64 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  27.88 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  27.35 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  27.78 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  29.05 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1854  DNA repair protein RadA  27.57 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1226  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  31.22 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  29.41 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 498 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  27.47 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  28.23 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  26.44 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  26.44 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3219  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  28.23 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  29.31 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  25.31 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  28.5 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  28.87 
 
 		 161 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  22.89 
 
 		 550 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  27.49 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  28.23 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  29.65 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4000  DNA repair protein RadA  28.1 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405173  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  24.39 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4095  DNA repair protein RadA  27.36 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2814  DNA repair protein RadA  29.33 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  28.36 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  28 
 
 		 462 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  26.39 
 
 		 457 aa  53.1  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  28.49 
 
 		 502 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  24.14 
 
 		 454 aa  52.8  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  27.75 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  27.5 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  26.42 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  27.64 
 
 		 456 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  28.98 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  27.88 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  26.59 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  31.55 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  26.37 
 
 		 143 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  35.25 
 
 		 570 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  27.64 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  28.08 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  23.92 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4932  DNA repair protein RadA  28.36 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  27.86 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  28.36 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  24.64 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  25.98 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  27.14 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  26.46 
 
 		 470 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  34.43 
 
 		 570 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  24.64 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  28.44 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.73 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  33.33 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  26.63 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  26.76 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  25.94 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  29.14 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2110  DNA repair protein RadA  25.37 
 
 		 452 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  26.24 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  29.3 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  28.29 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>