More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1732 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  89.4 
 
 		 464 aa  749    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 462 aa  923    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  67.43 
 
 		 465 aa  580  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  63.97 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  56.55 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  51.82 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  54.23 
 
 		 449 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  50.81 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  51.82 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  54.06 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  51.02 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  51.59 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  51.14 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  53.12 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  53.58 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  52.89 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  51.61 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  55.67 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  53.78 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  51.96 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  54.57 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  56.27 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  52.1 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  50.91 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 453 aa  415  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  49.43 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  50.25 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  52.22 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  52.59 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  47.84 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  47.84 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  50.81 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  49.41 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.58 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  51.05 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  50.57 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  46.09 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  50.57 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 518 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  45.19 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  45.68 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  45.68 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  47.25 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  51.18 
 
 		 408 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  48.26 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  44.5 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 455 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  48.17 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.03 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  48.26 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  47.78 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  45.48 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  45.48 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  47.83 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  45.92 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  44.76 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  45.83 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  46.52 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  44.92 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  47.91 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  47.92 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  50.84 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  47.81 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.93 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  47.81 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  49.16 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>