More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0842 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 448 aa  912    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  67.26 
 
 		 450 aa  596  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  62.64 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  62.42 
 
 		 446 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  61.3 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  60.85 
 
 		 446 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  60.85 
 
 		 446 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  61.3 
 
 		 446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  61.97 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  59.46 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  46.8 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  45.16 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  45.48 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  45.7 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  45.5 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  51.08 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.76 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.64 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  45.89 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  47.33 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  44.67 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.17 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.95 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  44.24 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  47.21 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  44.85 
 
 		 520 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  44.94 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  45.67 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  47.21 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  43.75 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  44.63 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.23 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  44.3 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  46.95 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.02 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  44.72 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  44.26 
 
 		 518 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  43.85 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  44.33 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  44.5 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  44.33 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 450 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  44.11 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  43.74 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  46.01 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4932  DNA repair protein RadA  45.8 
 
 		 457 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.4 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  45.52 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  44.57 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  44.55 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  43.74 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  41.59 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  41.37 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  46.29 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  43.88 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  46.98 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  44.58 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  44.23 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  41.15 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  41.46 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  48.4 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>