44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2049 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  100 
 
 		 334 aa  679    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  57.66 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  50.75 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  50.31 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  39.69 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  37.76 
 
 		 357 aa  218  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  38.51 
 
 		 341 aa  211  9e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  50.32 
 
 		 161 aa  175  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  35.29 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  30.99 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  32.82 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  35.86 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  30.73 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  31.32 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  31.9 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  33.95 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  30.56 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0363  DNA repair protein RadA  26.26 
 
 		 465 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  30.53 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  28.4 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  27.6 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  29.73 
 
 		 446 aa  46.6  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  35.87 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  34.07 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  26.74 
 
 		 448 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 441 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  31.75 
 
 		 446 aa  46.6  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  35.87 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  35.87 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  27.64 
 
 		 451 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  30.14 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  32.08 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  24.18 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  26.05 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0749  DNA repair protein RadA  26.49 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.925672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  27.23 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  29.9 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  32.38 
 
 		 470 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  26.75 
 
 		 496 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  26.34 
 
 		 454 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  25.62 
 
 		 458 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  25.27 
 
 		 444 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>