More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0363 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0363  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 465 aa  944    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  53.7 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0749  DNA repair protein RadA  45.52 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.925672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  39.35 
 
 		 454 aa  343  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  38.66 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  40.34 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  38.03 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  38.99 
 
 		 449 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  37.37 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  37.53 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  37.31 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  39.86 
 
 		 466 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  38.01 
 
 		 450 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  38.71 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  39.19 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  39.19 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  42.46 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  39.09 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  38.58 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  37.77 
 
 		 453 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  38.44 
 
 		 457 aa  322  7e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 484 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  39.34 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  37.93 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  38.51 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  39.95 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  38.41 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  36.9 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 458 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  37.8 
 
 		 452 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  36.21 
 
 		 448 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  38.54 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  37.28 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  37.28 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  37.07 
 
 		 489 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  38.81 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  38.01 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  38.01 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  37.61 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  38.48 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  37.28 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  35.88 
 
 		 461 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  37.39 
 
 		 453 aa  312  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  37.55 
 
 		 466 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  35.7 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  36.77 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  37.77 
 
 		 457 aa  312  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  37.1 
 
 		 451 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  39.04 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  36.07 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  39.82 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  36.15 
 
 		 470 aa  310  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  36.11 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  38.34 
 
 		 453 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  38.99 
 
 		 453 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  37.93 
 
 		 454 aa  310  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  36.32 
 
 		 455 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  39.02 
 
 		 455 aa  310  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  37.58 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  35.62 
 
 		 455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  37.14 
 
 		 462 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  39.18 
 
 		 446 aa  309  6.999999999999999e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  36.23 
 
 		 481 aa  309  8e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  37.07 
 
 		 456 aa  309  8e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  36.85 
 
 		 459 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  36.27 
 
 		 453 aa  309  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  38.41 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  38.25 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  36.99 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  35.13 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  35.43 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  35.19 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  35.59 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  37.07 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  38.72 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  34.99 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  36.94 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  40.14 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  37.42 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  36.85 
 
 		 459 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  37.36 
 
 		 462 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  37.92 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  35.82 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  35.82 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  39.17 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  35.9 
 
 		 477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  34.98 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  37.47 
 
 		 476 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>