33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1277 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  100 
 
 
326 aa  666    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  86.77 
 
 
333 aa  588  1e-167  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  52.29 
 
 
335 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  50.31 
 
 
334 aa  350  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  39.24 
 
 
357 aa  218  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  36.98 
 
 
345 aa  209  5e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  39.55 
 
 
341 aa  208  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  46.67 
 
 
161 aa  161  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  33.69 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  29.72 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  33.16 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  28.93 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  31.18 
 
 
360 aa  75.9  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  30.17 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  30.81 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  30.86 
 
 
392 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  27.32 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  30.94 
 
 
164 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  28.98 
 
 
394 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  32.03 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  29.29 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  40.91 
 
 
496 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  24.61 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  26.98 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  52.78 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  43.4 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  24.24 
 
 
454 aa  43.9  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  23.74 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  26.88 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  41.51 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  41.51 
 
 
454 aa  42.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  27.67 
 
 
235 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>