More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1786 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 235 aa  463  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  71.49 
 
 		 227 aa  324  9e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  68.26 
 
 		 235 aa  321  5e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  71.3 
 
 		 235 aa  298  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  57.58 
 
 		 275 aa  295  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  45.61 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  42.54 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  42.11 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  45.41 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  42.17 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  38.33 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  40.18 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  38.39 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  38.84 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  35.78 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  34.7 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  36.07 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  35.78 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  35.16 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  33.33 
 
 		 324 aa  104  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  34.18 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  36.17 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  33.33 
 
 		 358 aa  102  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  34.04 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  34.3 
 
 		 350 aa  99.8  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  34.32 
 
 		 330 aa  99.8  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  33.9 
 
 		 330 aa  98.2  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  31.97 
 
 		 358 aa  95.5  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  32.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  32.63 
 
 		 324 aa  91.3  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  32.74 
 
 		 325 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  31.73 
 
 		 325 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  31.82 
 
 		 324 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  33.06 
 
 		 322 aa  86.3  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  30.86 
 
 		 327 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  32.55 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  30.86 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  31.47 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  29.41 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  30.58 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  32.2 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  31.82 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  29.44 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  28.4 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  29.55 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  28.38 
 
 		 658 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  28.74 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  29.15 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  28.74 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  30.49 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  29.15 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  28.35 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  34.04 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  27.35 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  28.64 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  25.73 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  25.31 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  26.86 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  25.73 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  25.31 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  25.31 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  25.31 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  25.31 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  25.31 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0075  recombinase A  28.17 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  25.31 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  26.36 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  26.27 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  25.31 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  24.9 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  38.79 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.92 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  25.94 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  25.94 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  26.36 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  25.73 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  26.97 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  26.97 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  26.86 
 
 		 337 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  25.31 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  33.7 
 
 		 554 aa  62  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  29.25 
 
 		 352 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  29.25 
 
 		 352 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  26.34 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0874  recA protein  27.23 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532648 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.61 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  27.96 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  26.03 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2630  DNA repair protein RadA  26.18 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  24.9 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  28.87 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  30.24 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  27.23 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>