75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1081 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  100 
 
 
380 aa  766    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  74.21 
 
 
380 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  66.32 
 
 
380 aa  520  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  63.95 
 
 
380 aa  511  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  30.16 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  31.3 
 
 
373 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  34.13 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  28.73 
 
 
378 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  32.93 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  34.22 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  33.16 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  34.05 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  34.97 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  28.57 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  30.73 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  25.68 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  32.93 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  30.99 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  28.28 
 
 
357 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  33 
 
 
143 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  28.71 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  26.99 
 
 
338 aa  60.1  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  25.28 
 
 
492 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  23.11 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  26.86 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  28.48 
 
 
161 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.38 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.98 
 
 
574 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  24.57 
 
 
508 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  27.61 
 
 
499 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 
482 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 
492 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  26.82 
 
 
501 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  28.11 
 
 
494 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  23.46 
 
 
338 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  21.01 
 
 
550 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
489 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  30 
 
 
446 aa  48.9  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  31.15 
 
 
226 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.67 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  26.8 
 
 
573 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 
506 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  27.32 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  25.25 
 
 
567 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.89 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  27.84 
 
 
466 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  27.24 
 
 
496 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  25.47 
 
 
289 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  30 
 
 
446 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  30 
 
 
446 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  25.25 
 
 
448 aa  46.6  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  26.34 
 
 
492 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.82 
 
 
563 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 
502 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  26.26 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  28.89 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.27 
 
 
484 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  23.73 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.19 
 
 
463 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  23.92 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 
229 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  27.45 
 
 
505 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  23.27 
 
 
507 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  26.42 
 
 
575 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.62 
 
 
504 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.5 
 
 
570 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  26.34 
 
 
498 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  28.89 
 
 
446 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  21.53 
 
 
584 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  26.83 
 
 
496 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  54.55 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 
402 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  26.34 
 
 
501 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  26.88 
 
 
452 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>