39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0525 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  100 
 
 
339 aa  681    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  60.73 
 
 
338 aa  410  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  54.95 
 
 
338 aa  377  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  28.34 
 
 
380 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  28.91 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  24.6 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  27.71 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  25.68 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  26.04 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  24.74 
 
 
380 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  31.21 
 
 
164 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  26.7 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  23.74 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  25.56 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  30.83 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  22.94 
 
 
502 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  26.07 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  25.65 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  24.8 
 
 
496 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
497 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  21.8 
 
 
236 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  27.06 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.98 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  23.95 
 
 
496 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  25.91 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  28.99 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  32.03 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  35.48 
 
 
143 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  26.05 
 
 
161 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 
461 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  27.5 
 
 
501 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  29.75 
 
 
335 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
497 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 
502 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  22.48 
 
 
855 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  29.9 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  24.46 
 
 
507 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  21.97 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  31.73 
 
 
482 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>