56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1868 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  100 
 
 
378 aa  755    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  76.94 
 
 
360 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  56.47 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  54.83 
 
 
373 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  67.98 
 
 
226 aa  309  5e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  90.72 
 
 
143 aa  186  6e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  29.19 
 
 
380 aa  129  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  36.94 
 
 
380 aa  126  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  28.73 
 
 
380 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  35.33 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  30.87 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  31.41 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  28.93 
 
 
326 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  28.5 
 
 
335 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  27.32 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  31.9 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  23.74 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  29.8 
 
 
161 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  25.31 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  25.25 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.69 
 
 
463 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  25.52 
 
 
394 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  28.25 
 
 
501 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  25.17 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 
518 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  26.01 
 
 
496 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  27.21 
 
 
563 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  24.13 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  25.99 
 
 
562 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  26.06 
 
 
498 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 
510 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  25.19 
 
 
492 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  26.35 
 
 
584 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  27.56 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  24.51 
 
 
510 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  25.88 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  27.72 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.95 
 
 
574 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  25.3 
 
 
565 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  26.37 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  28.3 
 
 
228 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  28.06 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  26.74 
 
 
550 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
498 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
481 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  24.8 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 
481 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  24.9 
 
 
484 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  24.29 
 
 
453 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  27.54 
 
 
492 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  25.08 
 
 
570 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  26.95 
 
 
560 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  25.55 
 
 
505 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  23.26 
 
 
482 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>