85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0411 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  100 
 
 		 394 aa  776    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  66.24 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  64.2 
 
 		 164 aa  211  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1839  hypothetical protein  64.29 
 
 		 72 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478865  hitchhiker  0.000656033 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  35.11 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  28.91 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  32.93 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  31.79 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  32.82 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  28.5 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  29.88 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  31.1 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  28.98 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  29.11 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  27.71 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  29.54 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  31.46 
 
 		 143 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  28.26 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 		 563 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  26.54 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  25.52 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  26.42 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  26.49 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  29.35 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  25.45 
 
 		 510 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  26.11 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  25.29 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  28.22 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  25.71 
 
 		 462 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0497  DNA repair protein RadA  27.12 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  22.89 
 
 		 550 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 510 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  26.87 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  25.94 
 
 		 560 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  24.03 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  24.54 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  25.12 
 
 		 492 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  27.88 
 
 		 562 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  33.91 
 
 		 570 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  26.42 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 498 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  33.04 
 
 		 570 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  26.41 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  25.61 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 		 498 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  26.15 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  26.27 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  26.72 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  26.72 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  27.05 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  26.15 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  26.62 
 
 		 161 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  24.79 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  24.07 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  26.04 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  28.49 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  30.51 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0199  DNA repair protein RadA  25.75 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  24.71 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  28.03 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  29.91 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  25 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  22.81 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0180  DNA repair protein RadA  25.75 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26521  DNA repair protein RadA  30.77 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  29.31 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  26.46 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  24.36 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  23.93 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  25.76 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  25.44 
 
 		 476 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  28.99 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  29.07 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1854  DNA repair protein RadA  26.46 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  25.27 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  23.26 
 
 		 453 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  24.58 
 
 		 475 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  25.96 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  24.36 
 
 		 507 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  28.7 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  27.17 
 
 		 476 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1803  DNA repair protein RadA  25.44 
 
 		 452 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>