43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1800 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  693    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  73.31 
 
 		 357 aa  531  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  71.47 
 
 		 341 aa  524  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  79.87 
 
 		 161 aa  273  3e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  39.69 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  37.74 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  35.65 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  36.98 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0450  hypothetical protein  68.64 
 
 		 118 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  25.55 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  28.71 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  25.99 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  28.14 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  28.14 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  29.7 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  27.27 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  26.94 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  24.8 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  29.17 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  25.89 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  26.26 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  27.06 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  23.71 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  23.59 
 
 		 453 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  24.54 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  25.13 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 		 456 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  26.5 
 
 		 454 aa  46.2  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0363  DNA repair protein RadA  26.26 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  25.77 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  23.3 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  26.09 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  22.56 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  27.2 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  24.41 
 
 		 450 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  26.8 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  29.67 
 
 		 143 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  22.68 
 
 		 451 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  26.18 
 
 		 483 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  24.87 
 
 		 441 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  23.63 
 
 		 453 aa  42.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>